Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FSCN1Q16658 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FSCN1Q16658 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms