Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TNXAQ16473 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TNXAQ16473 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
TNXAQ16473 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms