Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SNCBQ16143 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SNCBQ16143 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SNCBQ16143 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SNCBQ16143 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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