Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP6AP1Q15904 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms