Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN9AQ15858 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN9AQ15858 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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