Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms