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| BRD3 | Q15059 | LINC02120-201 | ENST00000505518 | 2008 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010300.1-201 | ENST00000600671 | 5134 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | SEC23A-202 | ENST00000537403 | 4215 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | MFSD8-216 | ENST00000641147 | 4009 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ZBTB37-201 | ENST00000367701 | 19128 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | CCDC30-203 | ENST00000428554 | 3063 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC066616.2-201 | ENST00000559334 | 1481 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | ZNF266-203 | ENST00000588933 | 3293 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC002546.1-201 | ENST00000588041 | 2504 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RTKN2-201 | ENST00000315289 | 2383 nt | TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL033397.1-201 | ENST00000502390 | 3653 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM71D-211 | ENST00000612183 | 1790 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | MFSD8-242 | ENST00000641690 | 4199 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | PP2D1-202 | ENST00000389050 | 2151 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | STXBP4-201 | ENST00000376352 | 15590 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | LCA5L-218 | ENST00000485895 | 2551 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | ERBIN-203 | ENST00000380938 | 4701 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | CFHR4-201 | ENST00000251424 | 1292 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | FAM24A-201 | ENST00000368894 | 596 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEFB110-201 | ENST00000371148 | 384 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL136084.2-202 | ENST00000433997 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | ST7-AS2-203 | ENST00000434993 | 918 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC026355.2-201 | ENST00000456755 | 723 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01445-202 | ENST00000458615 | 679 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GPX5-203 | ENST00000469384 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | PPIAP15-201 | ENST00000479662 | 484 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | CSN1S1-202 | ENST00000505782 | 871 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | CSN1S1-204 | ENST00000507772 | 895 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC118465.1-201 | ENST00000513820 | 1271 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | HMGN1P28-201 | ENST00000521340 | 364 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC069228.1-202 | ENST00000550272 | 737 nt | TSL 3 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | GNRHR2P1-201 | ENST00000555315 | 631 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | HSPE1P5-201 | ENST00000561489 | 272 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | COX6CP3-201 | ENST00000580869 | 223 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4715-201 | ENST00000584117 | 79 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00907-210 | ENST00000593316 | 847 nt | TSL 3 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC234771.5-201 | ENST00000600161 | 514 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC012409.3-201 | ENST00000611343 | 981 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008121.2-201 | ENST00000614647 | 523 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR10A6-202 | ENST00000623991 | 945 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | SATB1-AS1-226 | ENST00000625515 | 776 nt | TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC019226.1-201 | ENST00000625666 | 515 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | SATB1-AS1-269 | ENST00000630766 | 591 nt | TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092442.1-201 | ENST00000636216 | 138 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4275-201 | ENST00000636486 | 87 nt | BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC018462.1-201 | ENST00000425966 | 1684 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | EVI5-208 | ENST00000540033 | 7436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMEM67-202 | ENST00000409623 | 3255 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | RTN4-209 | ENST00000405240 | 4061 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF117-203 | ENST00000610793 | 1374 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | SCOC-202 | ENST00000394201 | 1795 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091534.1-201 | ENST00000548779 | 1751 nt | TSL 2 BASIC | 4.37 | □□□□□ -1.71 | | |