Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAM2Q15035 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms