Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SQLEQ14534 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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