Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SCARB2Q14108 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms