Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms