Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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