Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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