Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CBX3Q13185 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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