Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX5Q9H2C1 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms