Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDO1Q16878 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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