Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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NREPQ16612 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
NREPQ16612 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
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