Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NEDD8Q15843 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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