Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ALX1Q15699 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms