Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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SS18Q15532 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SS18Q15532 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SS18Q15532 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SS18Q15532 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SS18Q15532 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
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SS18Q15532 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SS18Q15532 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SS18Q15532 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SS18Q15532 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SS18Q15532 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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