Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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