Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SHPRHQ149N8 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SHPRHQ149N8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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