Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SEMA3FQ13275 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SEMA3FQ13275 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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