Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGDRQ13258 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms