Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SRSF6Q13247 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms