Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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