Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PRDM2Q13029 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PRDM2Q13029 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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