Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RBBP4Q09028 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms