Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RPS29P62273 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
RPS29P62273 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
RPS29P62273 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
RPS29P62273 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
RPS29P62273 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
RPS29P62273 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RPS29P62273 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RPS29P62273 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RPS29P62273 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms