Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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HOXD10P28358 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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HOXD10P28358 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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HOXD10P28358 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
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HOXD10P28358 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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HOXD10P28358 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HOXD10P28358 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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