Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
LRIG3Q6UXM1 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
LRIG3Q6UXM1 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
LRIG3Q6UXM1 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
LRIG3Q6UXM1 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
LRIG3Q6UXM1 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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