Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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