Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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