Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SCN9AQ15858 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SCN9AQ15858 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SCN9AQ15858 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SCN9AQ15858 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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