Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SEC23BQ15437 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms