Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms