Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SPTAN1Q13813 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms