Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ATP1A4Q13733 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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