Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
ATRQ13535 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
ATRQ13535 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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