Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms