Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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NME3Q13232 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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