Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXF1Q12946 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms