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| FOXF1 | Q12946 | ARID2-206 | ENST00000457135 | 4356 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | CEP70-211 | ENST00000484888 | 1993 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.36 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC004925.1-201 | ENST00000624256 | 2706 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | OR5T1-202 | ENST00000641665 | 1471 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF1 | Q12946 | DEFB119-202 | ENST00000376315 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RNA5SP184-201 | ENST00000411071 | 108 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPS20P25-201 | ENST00000412447 | 352 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF1 | Q12946 | AC002076.2-201 | ENST00000617362 | 122 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | U73479.1-201 | ENST00000618062 | 168 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
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| FOXF1 | Q12946 | ITGA9-AS1-218 | ENST00000630762 | 751 nt | TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | PABPC1P7-201 | ENST00000413177 | 1513 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC010733.2-201 | ENST00000589496 | 5702 nt | BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | ANKAR-209 | ENST00000520309 | 4410 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.35 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | CYLC2-201 | ENST00000374798 | 2171 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AMY2B-208 | ENST00000610648 | 1736 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MYOT-202 | ENST00000421631 | 1474 nt | TSL 2 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AGTR1-204 | ENST00000418473 | 2071 nt | TSL 5 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MIR196B-201 | ENST00000384852 | 84 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | USP9YP20-201 | ENST00000419224 | 558 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC023128.2-201 | ENST00000420880 | 1223 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC023469.2-201 | ENST00000425983 | 657 nt | TSL 5 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL078601.2-201 | ENST00000429444 | 474 nt | TSL 2 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL590103.1-201 | ENST00000434488 | 307 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC010723.1-201 | ENST00000435111 | 540 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC004691.1-201 | ENST00000440376 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | CNTN4-AS2-201 | ENST00000447256 | 426 nt | TSL 3 BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPL23AP15-201 | ENST00000450202 | 459 nt | BASIC | 2.34 | □□□□□ -2.03 | | |