Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
IFFO1Q0D2I5 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms