Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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PTPREP23469 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPREP23469 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPREP23469 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPREP23469 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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PTPREP23469 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PTPREP23469 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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