Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CGGBP1Q9UFW8 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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