Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
MSMPQ1L6U9 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms