Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
CLPPQ16740 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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