Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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