Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GRIK5Q16478 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms