Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GRIK4Q16099 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GRIK4Q16099 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms