Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
VPS72Q15906 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms